장기보유특별공제는 토지와 건물에 대하여 보유기간이 3년 이상인 경우에 양도차익의 일정비율을 공제합니다(법95 ②). - 2006년 공제율 개정

 ※ 기준면적 미만 비과세 고가주택의 장기보유특별공제는 2003년, 2004년, 2005년 양도분까지 적용합니다. 

양도소득기본공제는 주식과 주식 외의 자산으로 구분하여 각각 연간(1과세 기간) 250만원을 공제합니다(법103 ①).
 - 연간 2회 이상 양도한 경우에는 먼저 양도하는 자산의 양도소득으로부터 순차적으로 공제합니다.

양도소득세의 세율은 자산의 종류, 보유기간, 보유자, 등기여부, 과세표준 등에 따라 각각 다릅니다(법104).

≫ 토지, 건물, 분양권, 영업권, 회원권 : 9%∼36%, 40%(2년 미만), 50%(1년 미만, 1세대2주택), 60%(1세대3주택 이상, 비사업용 토지), 70%(미등기양도)

≫ 주식 : 10%∼30%

감면세액은 조세특례제한법상 양도소득세를 감면하는 것으로 규정된 경우에 한하여 이를 산출세액에서 공제합니다(조특법69, 70, 77, 97, 97의2, 99, 99의3).